新宿シニアはNPO法人登録をした2004年から、登録地域である新宿区の青少年育成のため、毎年12月に「新宿シニア会長杯少年野球大会」を開催しています。 　第1回大会は2004年12月11日（土）に、神宮外苑軟式球場で開幕しました。以来、新宿区を中心とした少年野球チームの年内最後の大会として定着し、大変ご好評をいただいております。主にアマチュア野球のメッカ・神宮外苑軟式球場を使用して開催されることも人気の理由です。新宿区内にあって交通アクセスの良い、アマチュア野球関係者にとってあこがれの神宮外苑で毎年大会を開催できることは、主催者にとっても大きな喜びのひとつです。 　第5回大会は2008年12月20日（土）、21日（日）、23日（祝）に開催され、落合コメッツが3年ぶり2度目の優勝を果たしました。。 第1回（2004年） 優勝：　準優勝：　3位 第2回（2005年） 優勝：落合コメッツ　準優勝：新宿ドリーム　3位：津久戸小野球教室 第3回（2006年） 優勝：淀四ライオンズ　準優勝：礫川　3位：ナインスターズ 第4回（2007年） 優勝：練馬レッドサンズ　準優勝：　3位